Module 7 BG

Високопроизводителните методики, основани на секвениране на едноклетъчна РНК и поддържащи възможността за разрешаване на процеса на секвениране в една клетка, включват:

Анотирането на транскриптите означава сглобяване на конструктите, като се използва съпоставяне с референтни геноми или сглобяване de novo

Par-SeqFISH е подход за експресиране на генома, който разкрива генната експресия в пространствен контекст с висока разделителна способност

Някои от протоколите, които улесняват анализите на частични транскриптоми на околната среда, включват:

Протоколът ProBac-seq използва библиотеки от РНК сонди и микрофлуидни търговски платформи за извършване на секвениране на едноклетъчна РНК

Подходите за едноклетъчна транскриптомика с комбинаторно баркодиране включват следните методи:

Транскриптомиката се занимава с РНК транскрипти, които са:

PETRI-seq е техника, която позволява профилиране на експресията на прокариоти чрез маркиране на РНК in situ, последвано от секвениране

Екологичната протеомика притежава потенциал за генериране на иновативни хипотези за микробните процеси

Екологичната транскриптомика извлича транскриптоми (мРНК) на микробни съобщества от околната среда, за да разбере техните взаимодействия и взаимодействията с околната среда

Микробните консорциуми в местообитанията на околната среда съставляват сложна и динамична система и носят всички трудности при генерирането и интерпретирането на техните транскриптомни данни

Основният протокол за анализ на частични транскриптоми на околната среда включва следния работен процес:

Техниките MATQ-seq изолират единични клетки в отделни ямки на еднокамерни плаки и извършват индивидуални реакции на индексиране за генериране на библиотеки за секвениране

При прокариотните транскрипти липсва механизъм за полиаденилиране и изолирането на ДНК не е лесно

Методът Seq-Well изследва клетъчно улавяне и баркодиране на базата на капчици