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La metabarcodificacion del ADNe consiste en tomar muestras ambientales, extraer el ARN, amplificarlo mediante PCR con cebadores generales o universales y secuenciar el producto de la amplificacion mediante NGS para generar una enorme cantidad de datos de secuenciacion en bruto.
El catastrofico vertido de petroleo de la plataforma Deepwater Horizon en 2010 en el Golfo de Mexico provoco la activacion de comunidades microbianas naturales con capacidad para degradar el petroleo. Para identificar las bacterias clave responsables de la biorremediacion natural, los cientificos utilizaron: