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Los enfoques omicos unicos, como la genomica, la transcriptomica, la proteomica o la metabolomica, pueden revelar los mecanismos biologicos de las comunidades microbianas complejas en respuesta a los cambios.
Las técnicas analíticas utilizadas para rastrear metabolitos incluyen: resonancia magnética nuclear (RMN), FPLC, espectrometría de masas, 1D-PAGE, matemáticas e informática.
La metatranscriptomica proporciona informacion clave sobre los genes expresados activamente en una comunidad microbiana, asi como sobre las funciones microbianas en las condiciones existentes en el momento del muestreo.