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La secuenciacion de nueva generacion (NGS) es una tecnologia de secuenciacion masiva en paralelo que ofrece una alta velocidad y escalabilidad del proceso de secuenciacion, junto con una secuenciacion profunda de las regiones de ADN diana y una alta precision de los resultados.
La metatranscriptomica es un metodo de alto rendimiento, independiente del cultivo, para cuantificar los niveles de ARNm expresado de comunidades microbianas complejas.
El catastrofico vertido de petroleo de la plataforma Deepwater Horizon en 2010 en el Golfo de Mexico provoco la activacion de comunidades microbianas naturales con capacidad para degradar el petroleo. Para identificar las bacterias clave responsables de la biorremediacion natural, los cientificos utilizaron: