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Los enfoques omicos unicos, como la genomica, la transcriptomica, la proteomica o la metabolomica, pueden revelar los mecanismos biologicos de las comunidades microbianas complejas en respuesta a los cambios.
La metabarcodificacion del ADNe consiste en tomar muestras ambientales, extraer el ARN, amplificarlo mediante PCR con cebadores generales o universales y secuenciar el producto de la amplificacion mediante NGS para generar una enorme cantidad de datos de secuenciacion en bruto.
La metagenomica es un enfoque global para estudiar las comunidades microbianas mediante el analisis de material genetico obtenido directamente de muestras ambientales, sin necesidad de cultivar especies especificas.