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2023-1-BG01-KA220-HED-000155777 – DigiOmica

Welcome to your Module 11 ES

?Que enfoques omicos son cruciales para caracterizar los microbiomas en relacion con la gestion medioambiental, la vigilancia y la biorremediacion?

La metatranscriptomica proporciona informacion clave sobre los genes expresados activamente en una comunidad microbiana, asi como sobre las funciones microbianas en las condiciones existentes en el momento del muestreo.

El desarrollo de biosensores innovadores para la diferenciacion de lantanidos (Ln) ligeros y pesados se basa en la combinacion de los siguientes enfoques omicos:

La flujomica estudia la dinamica de los procesos metabolicos y proporciona informacion sobre los niveles reales en las redes metabolicas, relacionados tanto con la actividad celular normal como en respuesta a cambios ambientales.

La metagenomica ayuda a responder a la pregunta "?cual es la composicion de la comunidad microbiana en diferentes condiciones?"

El catastrofico vertido de petroleo de la plataforma Deepwater Horizon en 2010 en el Golfo de Mexico provoco la activacion de comunidades microbianas naturales con capacidad para degradar el petroleo. Para identificar las bacterias clave responsables de la biorremediacion natural, los cientificos utilizaron:

?Que cepa de bacterias es capaz de degradar el tricloroetileno, el tricloroetileno y el metabolito toxico cis-dicloroetileno (cDCE) acumulados en las aguas subterraneas?

La genomica estudia el material genetico de comunidades enteras de organismos.

La metatranscriptomica es un metodo de alto rendimiento, independiente del cultivo, para cuantificar los niveles de ARNm expresado de comunidades microbianas complejas.

Los enfoques omicos unicos, como la genomica, la transcriptomica, la proteomica o la metabolomica, pueden revelar los mecanismos biologicos de las comunidades microbianas complejas en respuesta a los cambios.

La metabolomica proporciona una evaluacion cualitativa y cuantitativa de los productos metabolicos secretados por la comunidad microbiana en diferentes condiciones ambientales.

?Cuales son las tecnicas omicas mas utilizadas para estudiar las bacterias fijadoras de nitrogeno y las rizobacterias con el fin de mejorar su eficacia en agrobiotecnologia?

La metagenomica es un enfoque global para estudiar las comunidades microbianas mediante el analisis de material genetico obtenido directamente de muestras ambientales, sin necesidad de cultivar especies especificas.

La proteomica es el estudio a gran escala de todas las proteinas expresadas en un momento dado por todos los organismos de un ecosistema.

La informacion sobre la expresion genica en una determinada muestra ambiental se obtiene capturando el ARNm total del microbioma y realizando una secuenciacion metatranscriptomica exhaustiva.