Module 11 BG

Щам на коя бактерия е способен да разгражда трихлороетен, трихлороетен и токсичния метаболит цис-дихлороетен (cDCE), които се натрупват в подпочвените води?

Метаболомиката предоставя качествена и количествена оценка на метаболитните продукти, секретирани от микробната общност при различни условия на околната среда.

Метагеномиката помага да се отговори на въпроса „какъв е съставът на микробната общност при различни условия?“

Флуксомиката изследва динамиката на метаболитните процеси и дава информация за действителните нива в метаболитните мрежи свързани както с нормалната клетъчната активност, така и в отговор на промените в околната среда.

Протеомиката е широкомащабно изследване на всички протеини, които се експресират в определен момент от всички организми в екосистемата.

Метагеномиката е цялостен подход за изучаването на микробни съобщества чрез анализ на генетичен материал, получен директно от проби от околната среда, без необходимостта от култивиране на специфични видове.

Метатранскриптомиката е високопроизводителен, независим от културата метод за количествено определяне на нивата на експресираната иРНК на сложни микробни общности.

Кои са най-често прилаганите омикс техники за изучаване на азотосвързващите бактерии и ризобактериите с цел подобряване на ефективността им в агробиотехнологията?

Геномиката изучава генетичния материал на цели съобщества от организми.

Прилагането на кои омикс подходи са от решаващо значение за характеризиране на микробиомите във връзка с управлението на околната среда, мониторинга и биоремедиацията?

Разработването на иновативни биосензори за диференциране на леки и тежки лантаниди (Ln) се основава на комбинирането на следните омикс подходи:

Катастрофалният разлив на петрол от Deepwater Horizon през 2010 г. в Мексиканския залив доведе до активиране на естествени микробни общности с нефтодеградиращ капацитет. За да идентифицират основните бактерии, отговорни за естествената биоремедиация, учените използваха:

Единичните омикс подходи като геномен, транскриптомен, протеомен или метаболомен, могат да разкрият биологичните механизми на сложни микробни общности в отговор на промените настъпили в екосистемите.

Метатранскриптомиката предоставя ключова информация за активно експресираните гени в едно микробно съобщество, както и за микробните функции при условията, съществуващи в момента на вземане на пробата.

Информацията за генната експресия в дадена проба от околната среда се получава чрез улавяне на общата иРНК на микробиома и извършване на цялостно метатранскриптомично секвениране.